[Обновлено 10 января 2019 г.]
Секвенирование собачьего генома, осуществленное в качестве публичного исследовательского проекта в 2004 году, открыло широкие возможности для генетического тестирования собак. Святым Граалем для многих ученых, занимающихся этой работой, является понимание и, в конечном счете, устранение наследственных болезней собак. Однако для многих владельцев собак самым захватывающим результатом этой серьезной работы является возможность точно узнать, из каких пород сделаны их дворняги.
Хотя уже есть несколько коммерческих компаний, предлагающих продукты, которые якобы способны делать именно это, наша оценка тестов на идентификацию породы заключается в том, что результаты могут быть такими же неоднозначными, как и собаки, которых они пытаются объяснить. Результаты тестов могут быть почти такими же разнообразными, интересными и приятными, как и у наших друзей-метисов, но кажется, что, по крайней мере сейчас, они не смогут полностью ответить на вопрос о происхождении вашей дворняги. Хотя тесты с каждым днем все лучше! И по мере того, как понимание ДНК, размер баз данных образцов и мощность компьютеров растут, вполне вероятно, что в какой-то момент тесты действительно оправдают маркетинговую рекламу, которая в настоящее время используется для их продажи.
Первый тест ДНК смешанной породы родился в лаборатории Элейн А. Острандер, доктора философии, и Леонида Кругилака, доктора философии, когда они работали в Центре исследования рака Фреда Хатчинсона в Сиэтле. доктора Острандер и Кругилак искали генетические сходства среди чистокровных собак, признанных Американским клубом собаководства (AKC). Одной из целей было обнаружить гены, ответственные за болезни, общие для собак и людей, включая несколько видов рака. Они также изучали родство около 100 пород, признанных AKC; это привело к открытию того, что генетические различия между породами собак намного больше, чем различия внутри пород. Для сравнения, генетическая изменчивость между человеческими популяциями составляет около 5,4%; они обнаружили, что у собак межпородная вариация оценивается в 27,5 процента.
В 2005 году Острандер и Кругилак подписали соглашение о коммерциализации с Mars Veterinary™, недавно созданным подразделением могущественной Mars, Incorporated (да, подумайте о конфетах, жевательной резинке, кормах для домашних животных и других пищевых продуктах), лицензируя технологию, которую они разработали для использования в породах. идентификация.
Компания Mars Veterinary была не одинока в гонке за выпуск продукта для идентификации породы. Ученые MMI Genomics Inc. (MMIG) также изучали собачью ДНК. Фактически, MMIG предоставляла услуги по проверке личности и отцовства для AKC, United Kennel Club (UKC), Professional Kennel Club (PKC) и ряда других кинологических реестров и клубов породы. MMIG изначально была подразделением Celera и возглавила частную деятельность по секвенированию собачьего генома. Кроме того, в марте 2007 года компания первой выпустила на рынок тест на идентификацию породы. MMIG назвала свой продукт тестом породы Canine Heritage™. Когда он дебютировал в коммерческих целях, тест потенциально мог идентифицировать только 38 пород; тест («XL») был модернизирован в середине 2008 года, чтобы идентифицировать более 100 пород.
Всего несколько месяцев спустя, в сентябре 2007 года, компания Mars Veterinary представила на рынке свой тест под названием Mars Veterinary Wisdom Panel™ MX.
Каждая компания продвигает свои тесты, заявляя, что они являются хорошим способом для владельца смешанной породы узнать, может ли его или ее собака быть восприимчивой к определенному генетически связанному заболеванию, если у собак есть породы, которые, как известно, наследуют определенные состояния. Они также говорят, что тесты помогают в дрессировке, давая владельцу представление о поведении собаки; причина, по которой собака ведет себя так, как она делает, может быть объяснена ее прошлым. В конце концов, однако, представители компании признают, что большинство их клиентов покупают тесты просто из любопытства и потому, что это весело.
Тесты ДНК, которые мы рассмотрели, берут свои базы данных из более чем 160 пород, признанных AKC, и касаются только тех пород, которые встречаются в Северной Америке. По оценкам, во всем мире насчитывается более 300 пород собак.
В тестах используются генетические инструменты, называемые «маркерами», для определения концепции породы собак. Генетический маркер — это положение в геноме, где существует вариабельность последовательности, которая наследуется в соответствии с правилами классической генетики. Двумя распространенными типами маркеров являются микросателлиты и однонуклеотидные полиморфизмы (SNP).
Каждая компания независимо разработала набор маркеров, которые определяют породы в своих базах данных, и использует сложные компьютерные алгоритмы для сопоставления ДНК данной смешанной собаки с ДНК в своей базе данных, чтобы найти для него наилучшее совпадение породы. Анализ определяет, насколько точно и в какой степени генетические модели собак смешанной породы совпадают с генетическими моделями чистокровных собак.
На рынке США есть два очень значительных игрока (MMIG и Mars Veterinary) и несколько, которые пытаются занять более крупную роль. EDP BioTech Corp. очень молода; четвертая компания, DNA Diagnostics Center Veterinary, поручает свою работу EDP BioTech Corp. по крайней мере один тест (Viaguard DNAffirm™), предлагаемый канадской компанией Accu-Metrics Ltd., который мы не исследовали.
Wisdom Panel MX был единственным тестом ДНК смешанной породы, для которого требовался образец крови. Первоначально доступный только через ветеринаров, тест теперь доступен онлайн непосредственно в Mars Veterinary, а также у ветеринаров и некоторых розничных продавцов товаров для животных. Рекомендованная розничная цена составляет 125 долларов США, включая бесплатную доставку при заказе непосредственно в Mars Veterinary. Тем не менее поездка к ветеринару вашей собаки по-прежнему необходима для забора крови, что означает дополнительные расходы на визит в ветеринарную клинику и процедуру, а также возможный стресс для вашей собаки, если она не любит ветеринарную клинику.
AKC признает 161 породу; База данных Mars Veterinary включает 153 породы AKC в свою базу данных, а также четыре породы, ожидающие признания AKC, всего 157 пород. Для разработки своей базы данных Wisdom Panel типировала более 13 000 собак во время разработки теста, выполнив более 19 миллионов анализов генетических маркеров. База данных Mars Veterinary — самая большая из трех исследованных нами компаний, но ее тестирование также и самое дорогое.
После извлечения ДНК из образца крови идентифицируются отдельные SNP или небольшие вариации состава ДНК. В тесте проверяется 321 точка или маркер, в которых обнаружены вариации, с целью формирования паттернов, характерных для породы. Затем к данным применяется собственный алгоритм.
Анджела Хьюз, доктор ветеринарной медицины, ветеринарный генетик и консультант Mars Veterinary, объясняет это тем, что компьютер затем «говорит» при просмотре ДНК конкретной собаки:«Если мне нужно сделать ей что-то одно, что будет лучше всего?» соответствие? Если два, что бы она соответствовала, то три, потом так далее, до восьми. В результате получается статистическая оценка для каждого «дерева», которое программа строит в зависимости от того, как эта собака лучше всего подходит». Восемь — это магическое число, так как уровень достоверности Mars Veterinary заключается в том, чтобы вернуться на три поколения назад (восемь прабабушек и дедушек).
Компания утверждает, что тест определяет породный состав с 90-процентной точностью, определяя это как проверочное тестирование, которое привело к средней точности 90 % для помесей первого поколения собак с известным происхождением (курсив наш).
Как и в случае с конкурирующим тестом Canine Heritage, результаты Wisdom Panel представлены в трех категориях, только Mars Veterinary называет их значительными, промежуточными и второстепенными породами, что примерно означает «родительские», «прародительские» и «прадедушки». Чтобы порода была занесена в список Значимых, по крайней мере 50 процентов ДНК собаки должны принадлежать этой породе (т. е. один из родителей был чистокровным или, возможно, оба дедушки и бабушки принадлежали к одной породе); Промежуточный, не менее 25 процентов; и незначительные, по крайней мере, 12,5 процента.
Ветеринарная служба Mars ожидает, что если ваша собака показывает Значимую породу, она, скорее всего, будет демонстрировать некоторые физические и поведенческие черты этой породы, если только некоторые гены не являются рецессивными. Для промежуточного уровня вы «можете» увидеть некоторые физические и поведенческие черты этой породы у вашей собаки, а для младшего маловероятно, что физические черты породы визуально представлены в собаке, если только некоторые гены не являются доминантными.
Компания цитирует две-три недели результатов испытаний; статус теста можно отслеживать в режиме онлайн, а результаты, когда они будут готовы, будут отправлены клиенту по почте, но доступны онлайн раньше. Единственная контактная информация компании, предлагаемая на веб-сайте, — это адрес электронной почты; каким бы бесполезным это ни было, сам веб-сайт предлагает массу информации.
Когда мы нашли номер телефона, чтобы связаться с компанией, ответивший представитель был умеренно услужлив, хотя он был более готов иметь дело с кем-то, кто звонит, чтобы обсудить результаты теста их собаки, чем с кем-то, кто ищет подробную информацию о компании и ее деятельности. продукты.
См. продукты Wisdom Panel здесь.
Последним участником рынка является ДНК-тест на определение породы, предлагаемый BioPet Vet Lab, подразделением EDP Biotech Corp. Сама BioPet Vet Lab была создана в конце 2007 года; его собачий ДНК-тест был запущен в начале 2008 года через онлайн-реселлеров. В дополнение к тесту на определение породы, BioPet также предлагает ДНК-тестирование для подтверждения отцовства, ДНК-идентификацию домашних животных и очень интересную программу PooPrints™ («сопоставьте беспорядок с помощью ДНК»).
Цель компании — предложить надежный и доступный тест. Компания надеется добиться этого, ограничив количество пород в своей базе данных до 63, что, по утверждению компании, представляет «около 93 процентов ДНК собак в США, согласно историческим тенденциям популярности породы», и установив цену теста в 60 долларов. . Добавление дополнительных пород требует добавления большего количества маркеров, что увеличивает стоимость; BioPet предполагает, что, скорее всего, его база данных превысит от 65 до 70 пород. В этом тесте также используется щечный мазок для сбора ДНК собаки.
Компания продает свои тесты через PetSmart, Pet Supermarket, других розничных продавцов и интернет-магазинов. Срок получения результатов составляет примерно две недели, и, похоже, у компании нет возможности онлайн-отслеживания статуса теста. Они повторно проведут тест по запросу, признавая возможность человеческой ошибки, но представитель компании Мэг Ретингер сообщила, что даже в тех тестах, которые они проводили повторно, они никогда не видели результатов теста, которые были бы совершенно другими при втором прогоне. На веб-сайте BioPet содержится умеренное количество информации, и представитель компании был полезен.
Руби, названная в честь ее короткого красного пальто, была доставлена домой к Розали и Леонарду Санчесам из Риверсайда, штат Калифорния, их 15-летним внуком, который получил ее от дамы, которая давала щенков из кузова пикапа. Женщина сказала их внуку, что щенок был помесью сенбернара. Розали быстро отмахнулась от его слов, решив, что он выдумал эту часть истории, потому что Руби совсем не похожа на сенбернара.
В начале этого года она узнала о тесте «Собачье наследие», и ей было любопытно узнать больше о биографии Руби. Она и ее муж предположили, что Руби была наполовину боксером. Их ветеринар согласился из-за больших лап Руби; он предположил, что это был боксер/немецкий дог или боксер/мастиф.
Когда пришли результаты, Розали была в шоке; ее внук все-таки был прав! Тест показал боксера и сенбернара. Хотя она до сих пор не может смириться с тем, что Руби не похожа на сенбернара, Розали говорит:«Собака смешанной породы похожа на коробку конфет. Никогда не знаешь, что внутри».
Подруга Дэна Маккарти нашла Флору лежащей рядом с автобусной остановкой, исхудавшей и покрытой блохами. Их ветеринар подумал, что Флора была помесью лабрадора и спрингер-спаниеля, но она была маленького роста, весила 30 фунтов в возрасте двух лет. Другие догадались, что это бордер-колли и джек-рассел-терьер.
Дэн, житель Голливуда, штат Калифорния, хотел узнать о Флоре как можно больше. «Я хочу знать, кем были ее мать и отец, где они сейчас, и показать им, что Флора выросла великой собакой с великой жизнью», — говорит он. Прошлым летом он заказал тест Canine Heritage. Результаты показали, что родители Флоры, вероятно, не были чистокровными — ничего из перечисленного в начальной категории, как и подозревал Дэн. Тем не менее, на среднем уровне сообщалось о немецкой овчарке и кокер-спаниеле. Дэн был поражен. «Спаниель объясняет, почему она такая маленькая, а овчарка объясняет, почему она такая умная!»
Китти Кэннон из Кристал-Бич, Флорида, и ее муж всегда играли в угадайку о породном составе своей собаки. Когда в 2008 году они узнали о тестировании ДНК, Китти подумала:«Почему бы и нет? Поскольку мы не можем позволить себе клонирование Фокса, возможно, зная его породы, мы сможем в будущем найти еще одну замечательную собаку с его чертами». Они предположили, что Фокс был наполовину колли или шелти. Когда пришли результаты их собачьего наследия, они были удивлены, получив бернского зенненхунда во второй категории, а чау-чау в категории «в миксе». Только высшее существо может знать наверняка, точны ли результаты, говорит Китти, «но мы замечаем некоторое сходство в том, откуда у него такой цвет меха, форма ушей и линия подбородка. Мы знаем, что с ним они сломали шаблон, и другого никогда не будет».
Эвелин Оренбух, ветеринар из Филадельфии, заказала Mars Veterinary Wisdom Panel MX для своей собаки-спасателя Пиа. «Я хотел знать, связано ли поведение Пии с породами, которые, как я думал, в ней есть. Мы угадали бордер-колли, уиппета и…? Результаты совпали только на самых низких уровнях, выявив немецкую овчарку и пару других пород. Доктор Оренбух была несколько разочарована, так как надеялась получить больше информации о происхождении Пии. Тем не менее, она говорит, что порекомендовала бы тест клиентам. «Знание пород вашей собаки поможет вам понять ее эмоциональные и физические аспекты. Возможно, это не изменит того, что вы делаете со своей собакой или как вы к ней относитесь, но может помочь вам понять ее».
Панель мудрости (продукт Mars Veterinary) подвергалась критике, поскольку требует посещения ветеринара и забора крови. Это увеличивает стоимость тестирования и может вызвать стресс у собак, не склонных к ветеринарам. Критики также предполагают, что образцы крови могут быть повреждены при транспортировке в лабораторию.
Mars Veterinary защищает свое решение использовать кровь, объясняя, что ДНК из образца крови является «золотым стандартом», поскольку качество и количество полученной ДНК лучше, чем из буккального (щечного) мазка. Доктор Хьюз из Mars Veterinary говорит, что ДНК в крови на самом деле очень устойчива, и лабораториям приходится постоянно повышать температуру ДНК почти до кипения во время анализа SNP. Компания также использует специально разработанные пластиковые пробирки для защиты пробирок для крови при транспортировке.
Тесты мазка из щеки подвергаются собственной критике. Буккальные мазки имеют более высокий уровень отказов из-за различий в отборе образцов владельцем, например, из-за недостаточного количества клеток. Кроме того, из-за наличия бактерий во рту собак существует вероятность роста бактерий при неправильном обращении с образцами.
Затем идет критика со стороны потребителей. Одна из постоянных тем недовольных клиентов заключается в том, что результаты теста ДНК не смогли обнаружить преобладание какой-либо конкретной породы в их «очень смешанных смешанных породах». (См. разделы ниже.)
Другая причина связана с тем, что некоторые собаки совсем не похожи на породы, обнаруженные их тестами. Трудно радоваться результату, который ничего не подтверждает и не объясняет в отношении внешности или поведения собаки, а объяснения этого явления компаниями могут быть неудовлетворительными.
На веб-сайте Wisdom Panel говорится:«Многие части собачьего генома, вероятно, не поддаются наблюдению или скрыты в отношении определения признаков. Это может произойти с любым количеством генов, определяющих признаки. Проще говоря, метисная собака может быть смесью трех или четырех пород, но иметь мало признаков, характерных для одной или нескольких из этих пород».
MMIG объясняет:«Тест собачьего наследия работает только для проверенных пород. Если породный состав вашего питомца содержит неподтвержденную(ые) породу(ы), тест может определить породу(ы) ранее в родословной вашей собаки. Это может привести к выявлению явно маловероятных пород для состава вашего питомца». Насколько достоверны результаты?
Чтобы получить некоторое представление от независимого эксперта по собачьей ДНК, мы взяли интервью у Бет Виктум, директора лаборатории ветеринарной генетики Школы ветеринарной медицины Калифорнийского университета в Дэвисе. Виктум работает в университете 30 лет. Она участвовала и была свидетельницей развития науки, позволяющей идентифицировать животное посредством изучения его тканей; за время ее пребывания в должности «современное состояние» перешло от определения группы крови к секвенированию генома.
Отвечая на просьбу прокомментировать тесты идентификации смешанных пород, Виктум подчеркнул, что тесты хороши настолько, насколько хороша база данных каждой компании; то есть, если порода не представлена в базе данных компании, тест определит следующее ближайшее совпадение. Она объясняет это тем, что чистокровные собаки, особенно зарегистрированные чистокровные, находятся под строгим контролем и имеют ограниченный генетический фонд.
«Большинство пород были созданы в результате интенсивного отбора за последние несколько сотен лет, поэтому у них не было достаточно времени, чтобы они разошлись в результате мутаций», — говорит она. Различия между породами заключаются в селективном разведении заводчиками по морфологии (структуре) или поведению. Таким образом, идеальным тестом породы будет тот, который рассматривает те черты, которые характеризуют каждую породу и делают их уникальными.
«Область генетики собак еще молода; геном собаки был секвенирован всего около пяти лет назад», — говорит она. «Мы только начинаем определять гены, ответственные за различные признаки».
Как и многие ученые в этой области, Виктум воодушевлен возможностью определения генетической основы различных заболеваний. Она говорит, что Лаборатория ветеринарной генетики в Калифорнийском университете в Дэвисе и Лаборатория Баннаша (также в Калифорнийском университете в Дэвисе) «идентифицируют генетическую основу различных заболеваний, которые затем могут быть предложены в качестве тестов для общественности. Если вы знаете, какие болезни могут возникнуть, вы сможете протестировать своего питомца, чтобы узнать, несет ли он мутацию».
Ее совет относительно ДНК-тестов метисов? «Хотя эти тесты могут указывать на породы, которые повлияли на генетический состав вашего питомца, вы должны понимать, что они не на 100% точны — и я не думаю, что они претендуют на это. Если у вас есть деньги, которые вы можете потратить, и вы хотите сделать это просто для удовольствия, тогда обязательно сделайте это».
Лаура Пескадор из Денвера, штат Колорадо, в мае 2008 года заказала тест «Собачье наследие» для Миши, ее «60-фунтовой, черно-подпалой, с квадратным носом, короткошерстной, большеухой, глубокогрудой и двуглазой загадочной смесью». Лаура считала, что комбинация пород, о которой ей сказали, когда она усыновила Мишу, маловероятна (австралийская овчарка/лабрадор-ретривер); она также надеялась получить бумажку, в которой говорилось, что Миша не помесь питбуля:«Не потому, что они мне не нравятся, а из-за специфического для породы законодательства моего города». Лаура была разочарована, получив «письмо с извинениями» с результатами, в которых говорилось, что тест не дал результатов! В ее сертификате рядом с «Основной» было написано «Непроверенная порода», а две другие категории были пустыми.
Скампер, Монти и Рейни — три собаки смешанной породы, принадлежащие ветеринару Дж. К. Бурчему из Олате, штат Канзас. В начале 2008 года она представила образцы крови каждой собаки на тест «Группа мудрости». Доктор Берчем был почти уверен, что Монти был «несколькими поколениями дворняг, скрещивающихся с дворнягами», и мало что ожидал от его результатов. Она называет Скампера смесью джек-расселов, басенджи и биглей, поэтому ожидала увидеть что-то подобное или даже какую-нибудь породу терьеров. Рейни нашли щенком в сельской Вирджинии, умершим от голода вместе с двумя однопометниками, все трое были похожи на бордер-колли.
Когда пришли результаты, доктор Берчем был разочарован. «Мне казалось, что это пустая трата денег! Рейни явно частично бордер-колли, и это был единственный достоверный результат, который я видел. Две из трех моих собак оказались «слишком сложными» для идентификации. Я мог бы тебе это сказать! Вот почему я заплатил за тест». Результаты Рейни показали «некоторых» бордер-колли; однако она показала отдаленные следы бриара, керн-терьера, немецкого дога и кеесхонда. Тест Монти выявил отдаленные следы аляскинского маламута, бигля, бородатого колли, чау-чау и гладкошерстного фокстерьера, а тест Скампера показал следы бриара, курчавошерстного ретривера и шетландской овчарки.
Главным разочарованием доктора Берчем было то, что она увидела Бриара у двух своих собак, что, по ее мнению, маловероятно. Ее также раздражало, что Скампера и Монти окрестили «чрезвычайно сложными собаками смешанной породы». Если только 10-15% собак смешанных пород попадают в эту категорию (согласно Mars Veterinary), как она могла иметь двух из них?
Я разделил разочарование доктора Берчем с доктором Хьюз, консультантом Mars Veterinary, и она предложила не просто посмотреть, но и повторить три теста. В год с тех пор, как Dr.
Берчем представил образцы, 23 дополнительные породы были добавлены в базу данных Mars Veterinary, а ее алгоритмы были изменены. Компания обнаружила, что программа разбивает собак на множество мелких частей, «теряя лес за деревьями», что приводит к некоторым ложным срабатываниям. Теперь результаты, как правило, представляют собой меньшее количество пород и, возможно, большее «количество».
Когда тест Рейни был проведен снова, бриар и керн-терьер не появились; они, скорее всего, были ложными срабатываниями. Бордер-колли поднялся до значительного (родительского) уровня, а немецкий дог и кешхаунд — до промежуточного (прародительского) уровня. Результаты Монти показали, что бигль и чау-чау перешли на промежуточный уровень (прародительский); другие породы все еще были очевидны, но их нельзя было назвать с уверенностью, поэтому они, вероятно, были ложноположительными в первом тесте.
Новые результаты Скампера по-прежнему выявили «очень смешанную собаку». Курчавошерстный ретривер перешел на промежуточный (прародительский) уровень, а золотистый ретривер появился на второстепенном уровне. Бриар и Шелти потенциально были частью ее далекой истории или ложными срабатываниями. Также были обнаружены анатолийская овчарка и австралийская пастушья собака, которые, по мнению доктора Хьюза, более вероятны, чем бриар и шелти.
Конечно, когда автор Лиза Родье предложила написать статью о тестах на идентификацию метисов, [хотела протестировать мою метисную собаку Отто — понимаете, ради журналистики! Но какой тест мы должны заказать, у какой компании? Мы быстро решили заказать наиболее обширный продукт у каждой из двух ведущих компаний отрасли и сравнить результаты.
У Отто была назначена встреча с ветеринаром, которую я использовал как возможность взять его кровь для Ветеринарной комиссии Mars. Мы следовали обычному протоколу:я заплатил ветеринару за забор крови и анализ; его сотрудники отправили образец в лабораторию и дали мне идентификационный номер теста, чтобы я мог проверить ход теста с помощью веб-сайта Wisdom Panel.
На следующий день я взял Отто с собой в PETCO, чтобы купить набор для теста MMIG Canine Heritage «XL» (с тех пор эта компания была куплена Wisdom Panel). Сотрудники отдела груминга PETCO прошли обучение в MMIG по сбору мазков со щек. После поездки к ветеринару накануне Отто нервничал, поэтому я сам взял мазок со щеки (но попросил сотрудника PETCO сфотографироваться с образцом и его почтовым конвертом, понимаете, для науки).
Ожидание результатов было мучительным, особенно после того, как компания Canine Heritage прислала мне электронное письмо на следующий день после того, как я отправил мазок из щеки, подтверждая его получение в лаборатории в Дэвисе, штат Калифорния (я живу примерно в 70 милях от Дэвиса). Это натолкнуло меня на мысль, что скоро я получу результаты, но на то, чтобы получить их по почте, ушло целых семь недель! (MMIG говорит, что результаты должны быть получены через шесть-восемь недель; это было только ожидание, из-за которого это ожидание казалось бесконечным. Плюс тот факт, что вы не можете получить результаты онлайн.) Я проверял веб-сайт на предмет результатов панели мудрости каждый день. Всего через три недели после того, как у Отто взяли кровь, я увидел, что результаты готовы и могу загрузить файл Adobe Acrobat, содержащий их.
Результаты Wisdom Panel показали:«Анализ показал, что Отто — довольно смешанная собака, и мы не нашли доказательств чистокровного родителя или бабушки и дедушки». (Кажется, я знал это!) Не было результатов на «значительном» или «промежуточном» уровне. Однако на «минорном» уровне появились эти четыре породы:немецкая овчарка, *басенджи, *чау-чау и *бордер-колли. Звездочками указано «Незначительное количество обнаружено с низкой достоверностью. Эти результаты не учитываются при расчетах точности». (Я:«Басенджи?!»)
Результаты собачьего наследия ничего не показали в категории «основной», чау-чау в категории «вторичный», а пудель и бордер-колли «в миксе». (Я:«ПУДЛ?!»)
Я бы догадался, что в Отто есть какая-то немецкая овчарка, и даже ожидал чау-чау. У него определенно хвост как у GSD, а уши очень чау-чау. Когда он промок до нитки, а его волосы зализаны, его телосложение немного напоминает золотистого ретривера. И я был уверен, что в нем должна быть какая-то терьерская порода. Как еще объяснить это пушистое лицо?
Приют, из которого я его усыновил, предположил, что это эрдельтерьер и бордер-терьер. (Я даю им передышку; ему было всего около пяти месяцев, когда они его забрали.) Хотя эта порода не фигурирует ни в базе данных «Собачье наследие», ни в базе данных «Панель мудрости», автор Лиза Родье болела за пикардийскую овчарку (Бергер Пикард). результат; она думает, что он звонарь собаки Винн-Дикси. Никто не угадал бордер-колли, пуделя или басенджи.
Как две компании могут иметь такие разные результаты для Отто?
Мы попросили Терезу Брэди, пресс-секретаря MMIG, ответить на этот вопрос. Она ответила:«Каждая компания разработала свой тест независимо, поэтому существует ряд факторов, которые могут привести к распознаванию разных пород у конкретной собаки. На этапе исследования каждая компания должна определить набор ДНК-маркеров, характеризующих различия между породами. Затем эти маркеры должны быть охарактеризованы в наборе собак, представляющих чистые породы.
«У разных компаний различаются не только эти маркеры, но и количество и источник чистокровных собак. Ни одна компания не может протестировать каждую породистую собаку, представляющую породу, и каждая компания разработала программное обеспечение, которое используется для сравнения этих генетических маркеров между породами.
«Однако некоторые породы являются близкородственными, потому что они были выведены в результате скрещивания более старых, более устоявшихся пород. For example, Boston Terriers were developed from the crossing of the English Bulldog and English White Terrier. So, depending on the software program, the markers established for the purebreds and the population of breeds in each company’s database, the same dog may test ‘Boston Terrier’ with one company and ‘English Bulldog’ with another.
“Some breeds are related because they arose from a common lineage, such as many of those breeds developed from Asia. Early on, we (MMIG) recognized that the Chow Chow, the Akita, the Siberian Husky, the Chinese Shar-Pei, and even the Shih-Tzu can cluster together as one general breed type so we developed an enhanced program and analysis procedure to split these apart. Thus it is not surprising that the companies may report slightly different results, especially for the breeds that have just a small representation in the mixed breed pet.”
Addressing any results that appear in the “Secondary” section of a report (where they detected Chow Chow in Otto), the MMIG (Canine Heritage) results packet says, “This category reports breeds that might be easily recognizable within your dog. While these breeds may or may not have a strong influence on your pet, each breed listed makes up less than the majority of your dog’s DNA.”
Addressing results that appear in the “In the Mix” section of a report (where they detected Poodle and Border Collie in Otto), the Canine Heritage packet says, “This final category identifies breeds that have the least amount of influence on your pet’s composition. They still appear, at low and measurable amounts, in your pet’s DNA. If your pet’s results only identify breeds in this category, it is possible your pet is composed of so many breeds only small influences from each breed can be detected.”
The Mars Veterinary (Wisdom Panel) results packet explains, “Because of the complexity of genetics and the passing on of dominant and recessive genes from generation to generation, every trait from the breeds we found may not always be visually apparent. It is important to spend time closely observing Otto’s appearance and personality. Think about which of Otto’s traits may reflect a combination of the breeds detected, and which seem to reflect just one of the individual breeds.”
I have to say that I found the whole exercise very interesting, but not necessarily worth the cost. Given that the results for my very mixed-breed dog were so weak, the idea that they might help me anticipate certain health or behavior problems linked to the breeds found is not very compelling. But I doubt that’s why most people order the tests; I think most of us are just curious.
Having spent so much time examining and admiring the technological achievements that went into the development of these DNA tests, Lisa Rodier was afraid I would pooh-pooh the science behind these tests because I was so skeptical of the breeds detected in Otto’s lineage. It’s not that; I trust the science. I believe there are traces of these breeds (and many others) in Otto. It’s just that I already knew he was a very mixed dog, just from a (free!) look at him. And if he wasn’t such a mixed bag – if he looked a lot like one particular breed, I’d probably be satisfied with the idea that he was mostly that breed; I wouldn’t spend $100-plus to confirm it.
That said, I must admit I will be interested to see how the results might change in a few years, after these companies put thousands and thousands more dogs into their databases. Which breeds will “fall off” of Otto’s results as meaningless “background noise”? Will the Picardy Shepherd be added? It could still develop that Otto is a limp-eared Picardy who fell out of a French tourist’s car somewhere in the Northern California wine country…We’ll check back with these companies in a few years, and let you know.
– Nancy Kerns
Canine mixed breed tests seem to be a very emotional topic. Those who have used the tests and have gotten the results they expected tend to be proponents, while those who received weak results or results that didn’t seem to square with the dog’s appearance tend to regret the purchase. But does that mean the tests don’t work? Here’s a stab at trying to explain some of what might be going on.
Dr. Hughes explained that most likely the dog’s parents and grandparents were themselves mixed breed, and a portion of the dog’s ancestry can be mixed beyond three generations which, for Mars Veterinary, is the extent of the company’s confidence. There is also the possibility that a breed is not covered in the database (for example, none of the tests’ databases include Rat Terrier) so the test will look for the most closely related breed.
Dr. Hughes explains that we want to associate a particular trait with one breed, but in actuality, it could be coming from a number of breeds. And when we move across breeds, combinations of genes can create very unusual outcomes.
One way she looks at the issue is first looking at a dog’s traits, defining what genes are necessary to get those traits, and then asking whether we can get those genes in a particular breed? For example, the merle color pattern, very common in Australian Shepherds, comes from a single gene, and a dog need only have one copy of that gene to exhibit that color pattern, And guess what? Dachshunds, Chihuahuas, and Great Danes can all provide that gene.
Black and tan coats are commonly associated with Rottweilers and Dobermans. But Chihuahuas, Cocker Spaniels, Dachshunds, and Poodles all carry this gene mutation. But in this case, it is recessive, so two copies must come together for
us to actually see that color pattern.
Meg Retinger of BioPet also points out that in some very mixed dogs, you might only see very subtle traits, such as the shape of the ear or the eyes. Her son’s dog tested as showing Beagle, yet she looks very much like a Labrador. When she howls, however, she sounds like pure Beagle!
We let Theresa Brady of MMIG address this, as she herself owns a Labradoodle. When she tested her dog using the Canine Heritage test, the results showed that Poodle was a Secondary breed, with Labrador Retriever “In the Mix.”
She explains, “You should know that my dog came from a breeder who claimed that the dog was seventh generation Labradoodle, which means that neither of her parents was a purebred (purebred Poodle or Retriever) and neither of their parents were purebred and so on. It makes sense, then, that she had nothing show up in Primary.” When I asked why the Poodle was Secondary, but not the Retriever, her guess was that the breeder probably crossed back more Poodle, looking for a more hypoallergenic coat. Dr. Hughes adds, “When breeding Labradoodle to Labradoodle, the “amount’ of Lab or Poodle genes passed down is random chance (think of a Pachinko machine). Testing the dog’s littermates may show very different proportions of each of these breeds. That being said, some ‘Labradoodle’ breeders are back-crossing Labradoodles to Poodles to change the size or coat of the dogs. I have seen some really strange looking Labradoodles!”
Increasing the size of the database, increasing the number of markers, and overall innovations in technology will see the tests become better tools. Also, as research continues on canine genetics, a better understanding of genes and how they relate to various breed traits will play a role in making a better test.
Lisa Rodier lives in Alpharetta, Georgia, with her husband and two Bouviers.
Никто не хочет видеть, как его питомец страдает. Для многих домашние питомцы — это всего лишь пушистые члены семьи. Вот почему для большинства владельцев это так опустошительно, когда они узнают, что у их собачьего компаньона диагностирован артрит. Как и у людей, артрит чаще встречается у собак сре
Помимо породы, собаки также могут различаться по цвету. Обычно они варьируются от черного до белого и многих оттенков между ними, включая красивый красноватый оттенок. Да, есть и рыжие породы собак. Тем не менее, красный тоже бывает разных оттенков. Он варьируется от мерцающего оранжевого, красного